國家基因組科學數據中心(NGDC)，實用功能全解！

國家基因組科學數據中心
NGDC

唯思派 2025/10/18

上一期我們已經初步了解了國家基因組科學數據中心(NGDC)的數據組成，錯過的小伙伴可以查看：生信寶藏 | 國家基因組科學數據中心(NGDC)——中國人自己的數據庫！那這一期跟隨小編一起進入NGDC的實用功能全解析吧！

National Genomics Data Center（NGDC）國家基因組數據科學中心（https://ngdc.cncb.ac.cn）是由中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）建設和維護的重要生物數據平臺，致力于收集、整合、存儲和分析全球基因組學及相關組學數據，為生命科學研究提供數據共享和分析服務。

該中心主要數據庫包括：組學原始數據歸檔庫（GSA）、基因組序列數據庫（GWH）、基因組變異庫（GVM）、生物項目數據庫（BioProject）、生物樣本數據庫（BioSample）、人類遺傳資源原始數據歸檔庫（GSA-Human）等，涵蓋基因組學、轉錄組學、表觀組學、蛋白質組學等多組學數據資源。這些數據庫嚴格遵循國際數據標準，支持數據提交、檢索、分析和可視化，為全球科研人員提供高質量的生物大數據服務，推動基因組學研究的開放共享和創新發展。

一、文獻搜索

OpenLB（開放生物科學圖書館）面向科研人員提供海量生物醫學文獻的免費訪問服務，同時整合了CNCB-NGDC關聯資源的直達路徑。該平臺匯聚了來自NCBI PubMed、bioRxiv及medRxiv的學術文獻，內容涵蓋標題、摘要、作者信息、期刊來源及參考文獻等元數據字段。

a. 訪問子庫https://ngdc.cncb.ac.cn/openlb/home

b. 在搜索框內填寫目標文章的標題、作者姓名、期刊名稱或相關關鍵詞后，點擊 "Search" 按鈕觸發檢索，系統將引導至結果展示頁面。用戶可在該頁面設置篩選條件，使系統僅呈現滿足特定要求的條目；若需查閱單篇文獻詳情，直接點擊對應文章標題即可訪問摘要等核心信息。

二、GeneBank下載

GenBase 是中國建設以對標美國國家生物技術信息中心（NCBI） GenBank 數據庫為目標的綜合性平臺。該平臺致力于存儲、管理并共享來自所有物種的基因序列、注釋信息及其對應的編碼蛋白質序列。通過提供一系列專門的 Web 服務，GenBase 支持研究者完成從基因序列數據的匯交、安全存儲、規范發布到便捷共享的全過程。此外，GenBase 整合了國際核苷酸序列數據庫協作組織 (INSDC) 發布的核酸和蛋白質序列資源，此舉顯著提升了國內科研工作者在數據查詢和數據獲取方面的效率。

a. 訪問子庫GenBasehttps://ngdc.cncb.ac.cn/genbase/

b. 利用基因名稱或 Accession 編號進行查詢，系統將返回匹配的核酸序列數據或蛋白質序列數據。

c. 根據搜索結果下載核酸或蛋白質序列。

三、NCBI 鏡像數據快速下載

NGDC 同步維護了 NCBI 等主流國際數據庫的鏡像資源，旨在為國內科研人員提供更高速的數據下載體驗。

SRA下載

作為國內首個組學原始數據歸檔平臺，GSA已實現NCBI SRA數據庫的全量元數據整合，并自2022年4月20日起同步更新其增量數據（涵蓋元數據與原始序列數據）。當前，GSA不僅支持對NCBI SRA數據庫的全方位檢索，還為研究人員提供INSDC關聯數據庫的標準數據訪問入口及新增數據的本地化訪問通道。

a. 訪問子庫https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa/

b. 輸入想要查詢的GSA編號信息，例如CRA009877，可以找到對應的原始數據的詳細信息，數據下載框點擊下載鏈接進行下載。